Inicialmente instalada no atual Edifício Histórico da Universidade do Porto, a FCUP encontra-se integrada, desde 2007, num moderno complexo situado no polo 3 (Campo Alegre) da U.Porto.
O campus da FCUP encontra-se distribuído por seis edifícios principais onde estão sedeados não só os serviços centrais, mas também cada um dos seus seis departamentos. O vasto campus da FCUP ocupa uma área correspondente a 60.000m² de construção, com dimensão semelhante de área verde ajardinada.
Fazem ainda parte do valioso património edificado da FCUP o Campus Agrário de Vairão (Vila do Conde), o Instituto Geofísico (Serra do Pilar - Vila Nova de Gaia), e o Observatório Astronómico Prof. Manuel de Barros (Monte da Virgem - Vila Nova de Gaia).