
O Conselho de Representantes é composto por quinze membros.
Este órgão de gestão é responsável por organizar o processo de eleição do Diretor, comunicar formalmente o resultado ao Reitor, bem como o respetivo programa de governo, aprovar regulamentos e alterações aos estatutos, apreciar atos de gestão, propor iniciativas para o bom funcionamento da instituição, e tomar decisões estratégicas sobre unidades de investigação e atribuições honoríficas.
O Conselho de Representantes é atualmente presidido pelo Professor John Greenfield.
Nos termos dos Estatutos da Faculdade de Letras da Universidade do Porto, o Diretor da FLUP é eleito em escrutínio secreto pelo Conselho de Representantes e proposto ao Reitor, de entre professores ou investigadores doutorados da Universidade do Porto ou de outras instituições, nacionais ou estrangeiras, de ensino universitário ou de investigação, que se tenham candidatado. O mandato do Diretor tem a duração de quatro anos.
A lista completa das competências da Diretora consta do artigo 20º dos Estatutos da FLUP.
A atual diretora da FLUP é a Professora Paula Pinto Costa.

O Conselho Executivo é um órgão de gestão da FLUP proposto pelo Diretor e ratificado pelo Conselho de Representantes. Este órgão de gestão é constituído pelo Diretor, que preside, três vogais docentes ou investigadores e um vogal funcionário não docente.
O Conselho Executivo é responsável por coadjuvar o Diretor no exercício das suas competências e exercer as competências delegadas pelo Conselho de Gestão da Universidade.
A atual constituição do Conselho Executivo da FLUP:
- Presidente: Professora Paula Pinto Costa
- Vogais docentes e investigadores: Professor Mário Jorge Lopes Neto Barroca (Subdiretor), Professora Elsa Maria Teixeira Pacheco, e Professora Maria Joana de Sousa Pinto Guimarães de Castro Mendonça.
- Vogal funcionário não docente: Lic. Carla Maria Gonçalves Augusto

O Conselho Científico é um órgão de gestão da FLUP composto por vinte e cinco membros, sendo constituído por: Presidente; Vice-Presidente, que é um dos vogais docentes ou investigadores do Conselho Executivo; Dezoito membros eleitos pelos docentes e investigadores; Cinco membros eleitos pelas Unidades de I&D.
A lista completa das competências do Conselho Científico consta do artigo 24º dos Estatutos da FLUP.
A Diretora da Faculdade é, por inerência, a Presidente do Conselho Científico.
O Conselho Pedagógico tem dezasseis membros, igualmente repartidos entre representantes do corpo docente e dos estudantes.
O Conselho Pedagógico da FLUP é responsável por se pronunciar sobre orientações pedagógicas, métodos de ensino e avaliação, aprovar planos de estudos, promover inquéritos e avaliações do desempenho pedagógico, apreciar queixas pedagógicas, aprovar regulamentos, propor prémios escolares, e decidir sobre o calendário letivo e mapas de exames.
O Conselho Pedagógico é atualmente presidido pelo Professor Mário Gonçalves Fernandes.
As funções previstas na lei para o Órgão de Fiscalização da FLUP são exercidas pelo Órgão de Fiscalização da U.Porto.